Программа FreeHand имеет свой формат — FH9 (последний символ в расширении файла указывает на номер версии программы). Формат "понимает" только сам FreeHand, Illustrator 7, 8 для Macintosh и несколько программ от Macromedia. 7-я и 8-я версии имеют полную кросс-платформенную совместимость.  Чтобы передать готовое изображение другой программе, обычно требуется записать его в более совместимом формате, например EPS. Поддерживает многостраничность. Графический язык FreeHand'a можно назвать PostScript-совместимым — он похож на него, но ряд эффектов текста, некоторые типы заливок не совместимы с PostScript. Формат программы FreeHand может содержать внедренные растровые файлы или только ссылки на них; внедрять файлы шрифтов не может.